Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALDH9A1P49189 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms