Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS1P48651 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms