Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UTRNP46939 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UTRNP46939 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UTRNP46939 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UTRNP46939 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UTRNP46939 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UTRNP46939 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UTRNP46939 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UTRNP46939 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UTRNP46939 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UTRNP46939 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UTRNP46939 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UTRNP46939 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UTRNP46939 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UTRNP46939 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms