Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms