Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF888P0CJ79 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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