Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTMAP06454 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTMAP06454 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTMAP06454 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms