Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1P04632 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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