Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERPINA1P01009 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERPINA1P01009 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINA1P01009 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINA1P01009 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINA1P01009 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINA1P01009 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINA1P01009 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINA1P01009 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINA1P01009 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERPINA1P01009 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERPINA1P01009 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms