Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN3O75935 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms