Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COCHO43405 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COCHO43405 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COCHO43405 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms