Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F3O00716 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F3O00716 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F3O00716 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms