Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf172C9J069 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf172C9J069 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms