Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK1Q9UPV9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms