Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC4Q9UBN4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms