Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCHIP1Q9P0W5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms