Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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RDH8Q9NYR8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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RDH8Q9NYR8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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