Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMBRD1Q9NUN5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms