Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NTN4Q9HB63 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NTN4Q9HB63 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms