Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms