Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VN1R3Q9BXE9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms