Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms