Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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