Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS8Q99627 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms