Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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