Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC7Q96M83 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms