Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC114Q96M63 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms