Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms