Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SRSF12Q8WXF0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms