Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SNX20Q7Z614 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SNX20Q7Z614 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SNX20Q7Z614 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SNX20Q7Z614 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX20Q7Z614 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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