Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS13

RALGPS1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor RalGPS1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1Q5JS13 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RALGPS1Q5JS13 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1Q5JS13 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1Q5JS13 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1Q5JS13 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1Q5JS13 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1Q5JS13 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms