Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms