Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms