Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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CDO1Q16878 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDO1Q16878 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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