Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLPPQ16740 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms