Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EXT1Q16394 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EXT1Q16394 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EXT1Q16394 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EXT1Q16394 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EXT1Q16394 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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EXT1Q16394 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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EXT1Q16394 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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