Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms