Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCOA1Q15788 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms