Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIP4Q15650 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP4Q15650 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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