Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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