Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB35Q15286 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms