Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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