Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMD6Q15008 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms