Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RAB39AQ14964 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms