Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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