Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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