Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LSAMPQ13449 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LSAMPQ13449 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LSAMPQ13449 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LSAMPQ13449 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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