Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHAF1BQ13112 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms