Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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