Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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