Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SRSF4Q08170 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms